高新技術(shù)企業(yè)是指在《國家重點(diǎn)支持的高新技術(shù)領(lǐng)域》內(nèi)，持續(xù)進(jìn)行研究開發(fā)與技術(shù)成果轉(zhuǎn)化，形成企業(yè)核心自主知識產(chǎn)權(quán)，并以此為基礎(chǔ)開展經(jīng)營活動，在中國境內(nèi)（不包括港、澳、臺地區(qū)）注冊一年以上的居民企業(yè)。
新辦法降低高新技術(shù)企業(yè)準(zhǔn)入門檻的同時，加強(qiáng)了監(jiān)管力度，對于企業(yè)而言，由于受研發(fā)項(xiàng)目、技術(shù)產(chǎn)品（服務(wù)）先進(jìn)性、財(cái)稅核算基礎(chǔ)以及內(nèi)部監(jiān)管體系等諸多因素影響，可能導(dǎo)致高新技術(shù)企業(yè)資格認(rèn)定被拒、補(bǔ)繳稅款及取消資格的風(fēng)險(xiǎn)。
 

（一） 研發(fā)項(xiàng)目不合規(guī)導(dǎo)致資格認(rèn)定無法通過的風(fēng)險(xiǎn)。

目前，新辦法配套的工作指引尚未出臺，原高新技術(shù)認(rèn)定辦法的工作指引《國科發(fā)（2008）362號》（以下簡稱362號文）對研發(fā)活動、研發(fā)項(xiàng)目的確認(rèn)以及其他指標(biāo)如核心自主知識產(chǎn)權(quán)、科研人員、銷售收入等有著明確嚴(yán)格的規(guī)定。

一般來說，新辦法的工作指引變化不會太大。參照原辦法的工作指引，如果企業(yè)申請資格認(rèn)定時，研發(fā)活動不是國家重點(diǎn)支持的高新技術(shù)領(lǐng)域內(nèi)，或者其他內(nèi)容任何一項(xiàng)指標(biāo)不達(dá)標(biāo)，都有可能面臨著高新資格認(rèn)定未通過的風(fēng)險(xiǎn)。

（二） 指標(biāo)核算口徑不規(guī)范引發(fā)監(jiān)管風(fēng)險(xiǎn)。

企業(yè)對高新認(rèn)定各項(xiàng)指標(biāo)理解各異，指標(biāo)計(jì)算容易出現(xiàn)偏差，導(dǎo)致各項(xiàng)指標(biāo)不能準(zhǔn)確反映高新技術(shù)企業(yè)的研發(fā)收入及費(fèi)用比例狀況。

如新辦法第六條規(guī)定：近一年高新技術(shù)產(chǎn)品（服務(wù)）收入占企業(yè)同期總收入的比例不低于60%。根據(jù)國家稅務(wù)總局關(guān)于發(fā)布《中華人民共和國企業(yè)所得稅年度納稅申報(bào)表（A類，2014年版）》的公告、國家稅務(wù)總局公告2014年第63號（以下簡稱63號公告）中的A107041《高新技術(shù)企業(yè)優(yōu)惠情況及明細(xì)表》填報(bào)說明規(guī)定：企業(yè)同期總收入應(yīng)為為稅法第六條規(guī)定的收入總額。包括：銷售貨物收入，提供勞務(wù)收入，轉(zhuǎn)讓財(cái)產(chǎn)收入，股息、紅利等權(quán)益性投資收益，利息收入，租金收入，特許權(quán)使用費(fèi)收入，接受捐贈收入，其他收入。但部分企業(yè)認(rèn)為總收入僅為主營業(yè)務(wù)收入和其他業(yè)務(wù)收入之和，直接導(dǎo)致的后果就是收入比例計(jì)算虛高，雖順利通過了高新資格認(rèn)定，未來也面臨著嚴(yán)格的高新技術(shù)企業(yè)復(fù)核和稽查風(fēng)險(xiǎn)。

（三） 研發(fā)支出加計(jì)扣除依據(jù)不足存在補(bǔ)繳稅款風(fēng)險(xiǎn)。

財(cái)政部、國家稅務(wù)總局《關(guān)于完善研究開發(fā)費(fèi)用稅前加計(jì)扣除政策的通知》（財(cái)稅（2015）119號文，以下簡稱119號文）及國家稅務(wù)總局《關(guān)于企業(yè)研究開發(fā)費(fèi)用稅前加計(jì)扣除政策有關(guān)問題的公告》（國家稅務(wù)總局公告2015年第97號，以下簡稱97號公告）中明確規(guī)定了可加計(jì)扣除的研發(fā)費(fèi)用。但仍有企業(yè)由于不熟悉政策，存在研發(fā)支出歸集不合理，加計(jì)扣除依據(jù)不足的現(xiàn)象。如97號公告規(guī)定，企業(yè)從事研發(fā)活動的人員和用于研發(fā)活動的儀器、設(shè)備、無形資產(chǎn)，同時從事或用于非研發(fā)活動的，應(yīng)對其人員活動及儀器設(shè)備、無形資產(chǎn)使用情況做必要記錄，并將其實(shí)際發(fā)生的相關(guān)費(fèi)用按實(shí)際工時占比等合理方法在研發(fā)費(fèi)用和生產(chǎn)經(jīng)營費(fèi)用間分配，未分配的不得加計(jì)扣除。實(shí)踐中企業(yè)自由調(diào)整空間較大，一旦被稽查機(jī)關(guān)認(rèn)定共用儀器設(shè)備或無形資產(chǎn)分配方法不合理或扣除依據(jù)不足，則可能面臨補(bǔ)繳稅款及滯納金的風(fēng)險(xiǎn)。

（四） 備案程序不合規(guī)或被取消高新技術(shù)企業(yè)資格。

新辦法規(guī)定企業(yè)獲得高新技術(shù)企業(yè)資格后，應(yīng)每年4月底前在“高新技術(shù)企業(yè)認(rèn)定管理工作網(wǎng)”填報(bào)上一年度知識產(chǎn)權(quán)、科技人員、研發(fā)費(fèi)用、經(jīng)營收入等年度發(fā)展情況報(bào)表，同時規(guī)定累計(jì)兩年未填報(bào)年度發(fā)展情況報(bào)表的將被取消高新技術(shù)企業(yè)資格，因此企業(yè)在取得高新技術(shù)企業(yè)資格之后，應(yīng)于每年4月底及時在網(wǎng)上填報(bào)年度發(fā)展情況表，否則超過兩年未填報(bào)就會被取消高新技術(shù)企業(yè)資格。


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